生物信息学接单ing」RNA-seq/单细胞/机器学习
生物信息学接单ing」RNA-seq/单细胞/机器学习
个人背景
教育标签:高校生物学硕士(生物信息学方向)
🔬 技能树构成:
湿实验:2年分子生物学实验经验(WB/荧光定量PCR/细胞培养)
干实验:掌握NGS全流程分析(上游比对→下游建模)
交叉领域:深度学习在组学数据中的应用探索
技术闪送卡
硬核模块:
🧬 组学流程:RNA-seq/ATAC-seq/ChIP-seq/scRNA-seq
✂️ 可变剪切:rMATS (novel isoforms) + SUPPA2 (事件可视化)
🤖 AI建模:XGBoost/LightGBM二分类 (AUC>0.9可复现)
🛡️ 免疫解码:CIBERSORT/ESTIMATE/MCP-counter微环境解析
极速接单通道
🚀 服务模式:
基础包:差异分析+富集分析
进阶包:多组学关联+机器学习建模(含SHAP可解释性报告)
📦 交付清单:
清洗后数据矩阵 (FPKM/TPM/Counts)
可发表级矢量图 (PDF/SVG/PSD)
中文注释代码 (R/Python/Jupyter)
典型应用场景
案例1:肺癌耐药机制探索
输入:PDX模型RNA-seq + 临床用药数据
关键步骤:
① DESeq2筛选耐药相关差异基因
② rMATS发现选择性剪接事件
③ 构建梯度提升树(XGBoost)分类模型
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