生物信息学接单ing」RNA-seq/单细胞/机器学习

生物信息学接单ing」RNA-seq/单细胞/机器学习


个人背景

 教育标签:高校生物学硕士(生物信息学方向) 

🔬 技能树构成:

湿实验:2年分子生物学实验经验(WB/荧光定量PCR/细胞培养)

干实验:掌握NGS全流程分析(上游比对→下游建模

交叉领域:深度学习在组学数据中的应用探索

技术闪送卡

硬核模块

🧬 组学流程:RNA-seq/ATAC-seq/ChIP-seq/scRNA-seq

✂️ 可变剪切:rMATS (novel isoforms) + SUPPA2 (事件可视化)

🤖 AI建模:XGBoost/LightGBM二分类 (AUC>0.9可复现)

🛡️ 免疫解码:CIBERSORT/ESTIMATE/MCP-counter微环境解析

极速接单通道

🚀 服务模式

基础包:差异分析+富集分析

进阶包:多组学关联+机器学习建模(含SHAP可解释性报告)

📦 交付清单

清洗后数据矩阵 (FPKM/TPM/Counts)

可发表级矢量图 (PDF/SVG/PSD)

中文注释代码 (R/Python/Jupyter)

典型应用场景

案例1:肺癌耐药机制探索

输入:PDX模型RNA-seq + 临床用药数据

关键步骤:

① DESeq2筛选耐药相关差异基因

② rMATS发现选择性剪接事件

③ 构建梯度提升树(XGBoost)分类模型

版权声明:
作者:Mr李
链接:https://www.techfm.club/p/209602.html
来源:TechFM
文章版权归作者所有,未经允许请勿转载。

THE END
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