mkgtf

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对下载的gtf进行过滤，只保留自己想要检测的feature类型，也可以全部保留
cellranger  mkgtf  input.gtf  output.gtf  /    #反斜杠“ / ”为了使命令换行输入不执行
--attribute=gene_biotype:protein_coding /
--attribute=gene_biotype:lincRNA /
--attribute=gene_biotype:antisense
  1. input.gtf : 要过滤的gtf的完整路径
  2. output.gtf : 过滤后gtf的完整路径和名称
  3. --attribute= : 过滤后要保留的feature类型，本身是一个键值对，等号后面的值应该是本身gtf中的feature类型格式，如这里的gene_biotype:protein_coding
  4. 如果要保留原有gtf中的全部feature类型，则不用加任何--attribute

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作者：主机优惠
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来源：TechFM
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