PE&MP
PE(Pair-End)和MP(Mate-Pair)都是双端测序,其主要区别在于建库方式的不同,而后期测序方式上基本没有差异
PE
建库
- 把DNA打断成长度为200-800bp的片段
- 在片段的两端加接头
- 建库结束后,采用桥式PCR进行扩增形成clusters
- 先测其中一条链;测完后,生成另一条链,切掉原来链;再测新生链

PE.png
MP
建库
- 把DNA打断成长度为2-10k的片段
- 末端修复,添加生物素,环化
- 把环化的DNA打断成200-600bp的片段
- 把其中富含生物素的片段筛选出来
- 在片段的两端加接头
- 建库结束后,采用桥式PCR进行扩增形成clusters
先测其中一条链;测完后,生成另一条链,切掉原来链;再测新生链
MP.png
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