现有的检测Crisp编辑结果的软件清单
二代测序分析Crisp的软件列表
| 检测工具 | 工具的特点 | 工具的论文期刊年份 |
|---|---|---|
| Hi-TOM2 | 在线网站，输入的文件大小有限制 | SCIENCE CHINA Life Sciences 2024 |
| CRISPResso2 | linux下conda或docker安装 | Nature biotechnology 2019 |
| CRISPR-GRANT | 全平台软件 win/mac/linux | BMC Bioinformatics 2023 |
| CrisprStitch | 全平台win/mac/linux | Plant Communications 2023 |
一代测序分析Crisp编辑信息的软件列表
| 工具名称 | 在线地址 | 离线应用地址 |
|---|---|---|
| TIDER | https://apps.datacurators.nl/tider | - |
| ICE | https://ice.editco.bio/ | https://github.com/synthego-open/ice |
| SuperDecode | http://www.crispr-ge.com/superdecode/ | https://github.com/xiexr/SuperDecode |
SuperDecode支持一二三代测序数据的分析。
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