课前准备—-细胞邻域特征评分

作者，Evil Genius

今天我们需要实现下面的目标

内容很简单，通过细胞类型邻域来表征ST spot。灰色spot表示感兴趣的细胞类型，橙色表示“恶性”spot，虚线表示其周围的spot。spot通过邻域巨噬细胞（不同的细胞类型）评分进行表征。

其中，为了表征每个“恶性”spot周围的细胞类型组成，计算了每个细胞类型的两个分数指数，以捕捉它们的微环境。将“邻居分数”定义为包含该细胞类型的周围spot的分数。因此，该分数直接测量了相邻spot中的细胞类型组成。邻近性分数测量感兴趣的spot与每个细胞类型之间的接近程度，并计算为最短距离的倒数，最短距离为该类型的细胞。

完整代码如下：